De luto, após a morte de Madre Francisca, no dia 14 de dezembro de 1876, a Congregação continuou seus ministérios sob a liderança da Superiora Geral Irmã Fulgência van Endert. Um segundo golpe ocorreu com o falecimento de Sarah Peter, em Cincinnati, pouco depois da morte de Madre Francisca.
O governo da Prússia, na sua “luta pela cultura” (Kulturkampf), continuava proibindo a recepção de novos membros. Em 1877, pela primeira vez, a profissão de votos temporários e finais teve lugar fora do território alemão, em Andrimont, na Bélgica. Enquanto isso, na Alemanha, as pré-noviças de segundo e mesmo de terceiro ano desejavam uma união mais estreita com a Congregação. Como solução conciliatória, essas prénoviças foram recebidas na Ordem Secular de São Francisco, recebendo um nome religioso e a permissão para participar dos exercícios espirituais da comunidade. Receberam uma boina preta e passaram a ser conhecidas como as “Noviças de Boné”. Oito dessas vocacionadas foram enviadas para os Estados Unidos, onde receberam o hábito. Durante o período da Kulturkampf, de 1871 a 1878, um total de 90 Irmãs tinha falecido e um número ainda maior não havia podido ministrar. Nessa época, assolada por epidemias, guerras e outras emergências, a Congregação não possuía um número suficiente de membros para servir os necessitados.
Mas em 1882, a Superiora Geral, Madre Vincência Maubach pediu ao Império Alemão para finalmente permitir a livre admissão de novos membros. A Congregação foi autorizada e recebeu 120 novos membros no ano seguinte. No dia 6 de fevereiro de 1883, pela primeira vez desde o final da Kulturkampf, 25 Irmãs celebraram sua profissão dos votos perpétuos na Casa Mãe, em Aachen. Nessa época, a Congregação estabeleceu muitos novos ministérios na Alemanha, inclusive um internato para empregadas domésticas e operárias em Bonn e atendimento domiciliary para doentes em Mainz, além de um hospital e de um orfanato em Euskirchen. As Irmãs também assumiram a administração do abrigo municipal dos sem teto em Düsseldorf, e do atendimento domiciliary e depois de um hospital em Bergisch Gladbach. Elas foram encarregadas da direção de uma creche e jardim da infância em Crefeld e de um lar de idosas em Bonn, e abriram dois novos hospitais, sendo um deles em Ratingen, e o outro, bem maior, em Siegburg.
Em 1882, quando Irmã Willeyka van Endert foi nomeada Vigária dos Estados Unidos, sentia-se angustiada com a promessa da Congregação de construir um hospital em Cincinnati para o qual faltavam os fundos necessários. Irmã Vincência Maubach, a Vigária precedente, tinha dito várias vezes que somente começaria a construir se Deus providenciasse ao menos dez mil dólares. Ao saber disso, o Arcebispo William Henry Elder a havia repreendido pela sua falta de confiança na Providência.
Mas em 1844, faleceu o grande filantropista de Cincinnati, Reuben Springer, que havia sido benfeitor da Congregação, deixando vinte mil dólares em seu testamento para as nossas Irmãs, que imediatamente usaram esse dinheiro para construir o St. Francis Hospital em Cincinnati.
Outras novas fundações nos Estados Unidos, nessa época incluem o St. Elizabeth Hospital, em Dayton, Ohio; o St. Margaret Hospital em Kansas City, Kansas; o St. Joseph Hospital da Rua 143 em Nova York, e o St. Anthony Hospital, em Columbus, Ohio. Em Aachen, 29 pré-noviças foram admitidas em janeiro de 1884, iniciando um ano inteiro de noviciado, como desejava o Arcebispo Paul Melchers, algo que não teria sido possível durante o auge da Kulturkampf, quando até as noviças haviam sido requisitadas para ministrar nas várias comunidades. No entanto, as noviças receberam uma preparação de somente três meses para a profissão dos votos temporários.
Em 1884, a Congregação recebeu permissão civil e eclesial de adquirir o antigo Convento Dominicano desocupado no bairro de Lindenplatz, em Aachen, pois como a Congregação estava crescendo, a Casa Mãe em Kleinmarschierstrasse já não era suficiente. Nove anos depois, no início de 1893, as Irmãs doentes foram transferidas para uma parte recém-reformada daquele antigo Convento Dominicano que foi chamado Convento S. Francisco. Por voltas de Pentecostes desse mesmo ano, a reforma em andamento permitiu a transferência da Casa Mãe para aquele antigo Convento. E no dia 14 de setembro, os restos mortais de Madre Francisca foram transladados do túmulo onde jaziam na Casa de Kleinmarschierstrasse, para o antigo Convento Dominicano che foi chamado Convento S. Francisco e a casa em Kleinmarschierstrasse foi designada como Convento Santa Clara.
Em 1893 as noviças dos Estados Unidos Antonina Blickhans e Aquilina Kroeger foram escolhidas para receber formação religiosa em Aachen. Mas as autoridades da Igreja nos Estados Unidos estavam começando a insistir na obrigatoriedade do ensino regular da doutrina cristã. O Rev. Bernard Nurre, OSF foi então designado para dar instruções semanais às nossas Irmãs dos Estados Unidos. Nesse mesmo ano foi publicada na Alemanha a biografia intitulada A Venerável Madre Francisca Schervier, escrita pelo Rev. Inácio Jeiler, OSF, da qual foi enviada uma cópia, em alemão, para cada casa da Congregação nos Estados Unidos. A primeira tradução ao inglês dessa biografia, feita pelo Rev. Bonaventure Hammer, OSF, foi publicada nos Estados Unidos em 1895.
Em 1894, Irmã Desideria Wolff recebeu permissão de Madre Willeyka para encontrar uma casa melhor onde estabelecer o Noviciado em Cincinnati. Nesse mesmo ano, ela adquiriu um terreno no bairro de Hartwell. A pedra fundamental do Convento Santa Clara foi colocada no ano seguinte. O cemitério foi dedicado no dia 11 de julho de 1896, onde Irmã Columba Voss foi sepultada nesse mesmo dia. O Convento Santa Clara foi erigido, sendo dedicado no 29 de outubro de 1896. As Reclusas lá iniciaram a sua adoração no dia 5 de novembro; e as outras Irmãs se mudaram para lá nos dias 28 e 29 desse mês, depois de um ritual com procissão e orações em cada cômodo do novo Convento Santa Clara em meio a lágrimas de alegria e de gratidão. Na Alemanha, no dia 19 de março de 1899, Festa de São José, as primeiras quatro aspirantes foram recebidas na nova casa do noviciado situada em uma antiga escola desocupada de Aachen, tendo sido designada uma Irmã para orientá-las. A Mestra das Noviças logo começou a instruí-las diariamente sobre o catecismo, os votos religiosos, as Constituições e os costumes da Congregação.
Inaugurada no dia 21 de abril desse mesmo ano, a Casa São Rafael foi designada para as professas temporárias, onde ficaram completamente separadas das noviças e da Irmãs de votos perpétuos.
Em 1901, por ocasião da celebração do 50º aniversário da tomada de hábito de Madre Francisca e das primeiras Irmãs, a Congregação contava com 1.400 membros, distribuídos em mais de 50 fundações. Em 1900, somente nos Estados Unidos, havia 459 membros.
